В Воронежском филиале ФГБУ «Центр оценки качества зерна» имеется бактериологический отдел, единственный в центрально-черноземном районе, работающий в этой системе. Отдел имеет лицензию на работу, а также аккредитован на различные виды микробиологических исследований в продуктах питания, хлебобулочных изделиях, сахаре, мелассе, муке, кормах и других видах сельскохозяйственной продукции.

Специалисты бактериологического отдела филиала проводят исследования по следующим показателям: патогенные микроорганизмы, в т. ч. сальмонелла, возбудители кишечной инфекции (кишечная палочка), мезофильные аэробные и факультативно-анаэробные микроорганизмы, плесени, дрожжи, в кормах – токсичные анаэробы и пр.

Баклаборатория оснащена всем необходимым для исследования оборудованием, питательными средами, автоклавами. Микробиологический анализ проводит опытный сотрудник, прошедший специальное обучение, имеющий сертификат и подтвердивший свою компетенцию результатами на ИК.

В 2019 году в испытательной лаборатории Воронежского филиала количество микробиологических исследований по сравнению с предыдущими годами значительно увеличилось. Из-за того, что требования к качеству кормов растут, многие хозяйства хотят убедиться в безопасности кормов по микробиологическим показателям.